羊肚菌形态:

    羊肚菌菌盖呈不规则圆形或长圆形,菌盖长8.2～10.5 cm，直径 2.0~2.8cm;菌盖与菌柄离生，菌盖中空，菌柄柱状，菌柄稍膨大， 中空，白色，菌柄长度3.7~4.0cm，直径1.0~1.3cm。子囊棒状， 无色，每个子囊内有8个子囊孢子，纵向或重叠排列，大小为 162~200μm×16.2~20.0μm;侧丝棒状，顶端膨大，大小为80.01 ~112.5μm×7.5~10.0μm;子囊孢子椭圆形，无色，大小为 10~16μm×7.5~12.5μm  
 
羊肚菌菌丝
      分为基内菌丝和表面菌丝。表面菌丝有明显主干，生 长初期为白色或淡黄色，有光泽，辐射生长，随后菌丝出现两 类分枝，一类形成次级主干，形态与一级主干类似；一类分枝 较短，并有部分菌丝伸入培养基内形成基内菌丝。后期，菌丝 颜色逐渐加深，呈浅褐色或褐色。光学显微镜下，幼龄菌丝细 而长，有隔，呈竹节状，分枝少。成熟菌丝粗，棕色，壁厚呈 黑棕色，节间距较短，分枝较多，顶端膨大呈棒状，大多分枝 呈锐角，少数呈直角。基内菌丝无主干，分枝多，间隔短，菌 丝粗大。

   羊肚菌种孢子分离或组织 分离后，放在12～18℃温度下培养观察。3天后培养基上萌发菌丝，每天仔细检查每支试管的发菌及变化情况。区分和认识各类杂菌是最关键的核心技术。

真正的羊肚菌菌丝最初为灰白色，生长很快，时间长会变成棕黄色，有时会出现菌核，母种7天长满试管，原种、栽培种15天可长满瓶底。是否分离成功，

必须做栽培出菇试验，待出菇后才能准确认定是否羊肚菌的菌种。一旦菌种分离成功，在以后的转接过程中要小心，不能再让杂菌感染，必须把好高温灭菌关和接种消毒关，才能保证菌种质量和成活率。

  待培养基表面余水干后才能使用，否则会被细菌感染。接种要求在接种箱内通过药物灭菌进行，将第一代纯母种挑取黄豆大一块带菌丝的培养基，放入空白培养基上，每支母种可接10～15支，母种只能扩种一次，不能多接或多扩，否则会影响子实体生长。

  接种后放在18～22℃温度下避光培养，2～3天菌丝萌发，7天可长满斜面培养基。如不使用则放入冰箱在0～3℃温度下保存，时间最长不超过半年。

还有羊肚菌的母种根据品种的不同性状有所不同，一般都会产生菌核，刚开始是白色，后来慢慢的变成黄色，在往后变成黄褐色，菌丝不像其它的菇种哪么密集

羊肚菌的鉴定 : 分子标记鉴定方法     基因组 DNA 提取方法 以鲜子实体为材料，利用 Biospin 真菌基因组 DNA 提取试剂盒提取DNA。
ITS 序列分析 采用真菌 通用引物 ITS4和 ITS5 。  测序 将 ITS-PCＲ 产物 进行纯化，纯化后的 PC Ｒ 扩增产物和引物直接 测序.